一、载体损害

档案信息都必须储存于某种载体，处于某种外部环境，因而会受到各种物理因素的制约。损害数字档案载体的主要原因是：

1、载体自身的损耗

电磁信号存储的不稳定性是损害数字档案安全的元凶，即使是存储性能较好的磁光介质，安全保存信息的寿命远不及纸张，难以担当起长久保管的重任。

2、不良环境的影响

数字档案所处环境的电磁干扰、光辐射、大气污染、温湿度等都可能对敏感的数字载体构成威胁。在传输过程中，数字档案以通讯设施为临时性载体，更易受环境变化的影响而发生信号的“跳变”，即便系统进行自动校验，也难免造成信息错乱现象。

3、自然灾害的破坏

对数字档案载体构成威胁的还有来自然界的各种灾害，如水涝、风暴、地震等灾害，对数字档案载体带来毁灭性破坏。

二、设备故障或破坏

存储和传输数字档案信息的环境是极其精密、复杂的电子、电气系统，运行过程中任何设备都可能因质量、损耗和操作等原因发生故障，导致文件信息的丢失或破坏，造成不可挽回的损失。因各种动机而对设备的蓄意破坏，更是安全的一大威胁，这种威胁的可怕之处是其危害往往不被察觉，不知不觉中泄露了档案机密，给国家造成巨大损失

三、操作失误

信息系统是人机交互系统，需要操作者给予指令，输入数据，因而存在误操作的可能。许多误操作是可以被系统校出并自动纠正的，但更多错误处理请求会造成系统运行错误，甚至导致系统瘫痪。造成误操作的主要原因是档案技术人员或管理人员安全观念淡薄、技术不熟练、责任心不强、不遵守操作规程等。误操作是安全威胁因素中的头号触发因素。

四、程序缺陷

无论应用程序还是系统程序都可能包括未被发现的缺陷或错误，这些缺陷或错误在运行过程中可能引起意外修改、泄露或使敏感的档案信息遭到破坏。